A luta de libertação em Tanganyika foi liderada pela União Nacional Africana de Tanganyika, cuja bandeira era uma tricolor horizontal de verde-preto-verde. As eleições confirmaram o apoio popular esmagador à organização, e as autoridades britânicas sugeriram que a bandeira do partido fosse modificada para ser usada como bandeira nacional após a independência em 9 de dezembro de 1961. Foram adicionados naquele período finsbriações amarelas.
Sob o domínio árabe, Zanzibar há muito tempo levava uma bandeira vermelha, mas um regime africano negro chegou ao poder em 12 de janeiro de 1964, sob uma bandeira preta, amarela e azul. No mês seguinte, o Partido Afro-Shirazi, no poder, introduziu uma nova bandeira nacional semelhante à sua. As listras horizontais azul-preto-verde representavam o mar, o povo e a terra, respectivamente, enquanto uma estreita faixa vertical branca no guincho era de paz.
Em abril de 1964, os países de Tanganica e Zanzibar se uniram e, no início de julho, suas tradições de bandeiras foram fundidas para criar a nova bandeira nacional da Tanzânia. As cores da bandeira foram incorporadas na diagonal para distinção. A maioria da população do país é simbolizada pela faixa preta, enquanto o verde sugere os ricos recursos agrícolas da terra. A riqueza mineral é refletida nas estreitas fronteiras amarelas, enquanto o Oceano Índico é simbolizado pelo azul. Depois que Zanzibar se uniu a Tanganyika, a bandeira de Zanzibar continuou a ser usada localmente nessas ilhas.
