O Partido Africano para a Independência da Guiné e Cabo Verde (PAIGC) encontrou pronto apoio nessas colônias portuguesas para sua mensagem de avanço social e econômico através da revolução política. Em 1961, adotou uma bandeira parecida com a dos países independentes vizinhos da Guiné e Gana, que estavam discutindo uma futura federação de terras da África Ocidental. Ao seu vermelho-amarelo-verde pan-africano, o movimento de libertação da Guiné-Bissau acrescentou uma estrela negra na faixa de elevação. Essa faixa e estrela correspondiam geograficamente à região costeira ocidental com sua capital, Bissau (da qual o nome nacional era derivado). As faixas horizontais na parte restante da bandeira e suas cores amarela e verde correspondiam aproximadamente às savanas do norte e às florestas do sul.
Oficialmente, dizia-se que a estrela negra era um símbolo da liderança do PAIGC, sua cor se referia ao povo africano e sua determinação em viver em dignidade, liberdade e paz. O amarelo foi interpretado como um símbolo da colheita e dos frutos do trabalho, tanto na agricultura quanto em outros aspectos. Green relembrou as vastas selvas e as terras agrícolas, que proporcionavam um meio de subsistência para a grande maioria dos cidadãos. A bandeira do partido também incorporou as iniciais PAIGC, omitidas quando a independência foi proclamada em 24 de setembro de 1973. Portugal não reconheceu a Guiné-Bissau ou sua bandeira até depois de sua própria revolução em 1974; no entanto, grande parte da Guiné-Bissau já estava sob controle do PAIGC e de sua bandeira. Cabo Verde acabou abandonando a política marxista do PAIGC e mudou sua bandeira nacional, mas a Guiné-Bissau mantém o desenho original.
