Comayagua, cidade, centro-oeste de Honduras, na margem direita do rio Humuya, em um vale fértil.
Fundada em 1537 como Valladolid de Santa Maria de Comayagua, a cidade serviu como capital colonial espanhola da província de Honduras. Uma variação de seu nome, Comayaguela, é usada no distrito governamental de Tegucigalpa. Sofreu danos nos levantes políticos do século XIX em Honduras e em rivalidade com Tegucigalpa pela posição de capital nacional, mas somente em 1880 a capital foi finalmente transferida para Tegucigalpa. A cidade também sofreu danos por vários terremotos e incêndios repetidos.
Os edifícios coloniais incluem uma notável catedral barroca espanhola (1715), quatro igrejas do século XVI e uma antiga universidade - a primeira na América Central, fundada em 1632. Comayagua fabrica produtos farmacêuticos, sapatos, resinas, produtos de cimento e cerâmica; é o centro comercial do oeste de Honduras. O Centro Agrícola nacional está localizado na cidade. Grande parte do centro da cidade, incluindo a catedral e o central park, foi reformada para restaurar a atmosfera colonial da cidade e o charme único.
A rodovia interoceânica passa pela cidade. Comayagua também possui um aeródromo, que foi atualizado no início dos anos 80 para uma base aérea militar. Nos arredores de Comayagua fica Palmerola, a principal base militar dos EUA em Honduras, que é compartilhada com a força aérea hondurenha. Pop. (2001) 55.368; (2013) 92.883.
