Existem duas fontes para as cores branco, azul e vermelho da bandeira nacional da Eslovênia. Por sua bandeira étnica nacional, a Eslovênia havia adotado uma cópia da bandeira russa, para demonstrar solidariedade com outros povos eslavos, na época das Guerras Napoleônicas. Ainda mais cedo, no entanto, o imperador romano sagrado havia concedido um brasão de armas à "Terra da Coroa de Carniola", que era então parte do império. Este brasão exibia um escudo branco com uma águia azul com um crescente xadrez vermelho e branco no peito. Outro brasão importante da história da Eslovênia foi o usado pelo condado de Celje - um escudo azul com três estrelas amarelas. Finalmente, sob o regime comunista do século XX, o brasão de armas da Eslovênia tinha linhas horizontais onduladas em azul e branco para sugerir a costa adriática do país, além de uma montanha estilizada de três picos - a mais alta da Eslovênia, o famoso Triglav.
A Eslovênia proclamou sua independência em 25 de junho de 1991, mas teve que lutar contra o exército iugoslavo para estabelecer sua soberania. A bandeira levantada no Dia da Independência era o tradicional tricolor branco-azul-vermelho-eslavo. Para distingui-lo das bandeiras semelhantes da Rússia e da Eslováquia, o novo brasão de armas da Eslovênia foi adicionado no canto superior da grua, sobrepondo as listras brancas e azuis. Esse escudo apresenta uma combinação das faixas onduladas Triglav e dos braços comunistas com as estrelas amarelas sobre fundo azul do escudo Celje.
