Igreja Ortodoxa Copta de Alexandria, também chamada Igreja Ortodoxa Copta, Igreja Ortodoxa Oriental e principal igreja cristã no Egito predominantemente muçulmano. O povo do Egito antes da conquista árabe no século VII identificou-se e sua língua no grego como Aigyptios (qibṭ árabe, ocidentalizado como copta). Quando os muçulmanos egípcios deixaram de se chamar Aigyptioi, o termo se tornou o nome distintivo da minoria cristã. Nos séculos 19 e 20, eles começaram a se chamar ortodoxos coptas, a fim de se distinguir dos coptas que haviam se convertido ao catolicismo romano (ver também Igreja Católica copta) e dos ortodoxos orientais, que são majoritariamente gregos (ver também Patriarcado Ortodoxo Grego de Alexandria).
Nos séculos IV e V, surgiu um conflito teológico entre os coptas e os romanos de língua grega, ou melquitas, no Egito. O Concílio de Calcedônia (451) rejeitou a doutrina monofisita - a crença de que Jesus Cristo tinha apenas uma natureza divina, não humana - e afirmou sua divindade e sua humanidade. Os melquitas reconheceram o resultado de Calcedônia. A igreja copta, no entanto, tornou-se uma das várias igrejas orientais que rejeitaram a linguagem cristológica sobre as duas naturezas de Cristo acordadas em Chalcedon. No entanto, enquanto as igrejas católicas romanas e ortodoxas orientais denunciavam essas igrejas orientais como hereges monofisitas, a igreja copta e outras igrejas ortodoxas pré-calcedonianas ou (desde o século XX) oriental adotavam uma posição teológica chamada miafisitismo. Confessando a declaração de São Cirilo de Alexandria (c. 375–444) proclamando a “natureza encarnada da Palavra” de Deus, os miafisitas declararam que a humanidade e a divindade de Cristo estavam igualmente presentes através da Encarnação em uma única natureza (daí a Prefixo grego mia, "o mesmo") que a Palavra feita carne. Em vez de negar a humanidade de Cristo, como foram acusados, as igrejas coptas e outras miafisitas deram a sua humanidade e sua divindade igual presença na pessoa de Cristo.
Após a conquista árabe do Egito no século VII, os coptas deixaram de falar grego, e a barreira do idioma aumentou a controvérsia. Várias tentativas de compromisso por parte dos imperadores bizantinos não deram em nada. Mais tarde, os califas árabes, embora tendessem a favorecer aqueles que adotaram o Islã, não interferiram muito nos assuntos internos da igreja. O jizya, o imposto cobrado dos não-muçulmanos que vivem em um estado islâmico, foi abolido no século XVIII.
O árabe é agora usado nos serviços da Igreja Ortodoxa Copta para as lições da Bíblia e para muitos dos hinos variáveis; apenas alguns pequenos abstenções que todos os que frequentam a igreja entendem não estão em árabe. Os cadernos de serviço, usando as liturgias atribuídas a São Marcos, São Cirilo de Alexandria e São Gregório de Nazianzus, são escritos em copta (o dialeto bohairico de Alexandria), com o texto em árabe em colunas paralelas.
A Igreja Ortodoxa Copta desenvolveu um sistema democrático de governo após a década de 1890. O patriarca e os 12 bispos diocesanos, com a assistência de conselhos comunitários nos quais os leigos estão bem representados, regulam as finanças das igrejas e escolas e a administração das regras relativas ao casamento, herança e outros assuntos de status pessoal. Quando o patriarca morre, um colégio eleitoral, predominantemente de leigos, seleciona três monges devidamente qualificados com pelo menos 50 anos de idade como candidatos ao cargo de patriarca. Entre esses três, a escolha final é feita por sorteio após a oração.
O bispo de mais alto escalão é o patriarca de Alexandria, que reside no Cairo; ele é chamado papa e reivindica autoridade apostólica por seu escritório em São Marcos. A igreja tem suas próprias escolas primárias e secundárias em muitos lugares no Egito, bem como um forte movimento da escola dominical para a educação religiosa de crianças incapazes de frequentar escolas coptas. Há um Instituto de Estudos Cópticos no Cairo, uma faculdade de teologia ligada ao instituto e um museu copta; o ensino da Igreja Ortodoxa Copta até se tornou a base do currículo usado na instrução religiosa de crianças cristãs nas escolas do governo.
Existem igrejas ortodoxas coptas em Jerusalém e em outras áreas da Terra Santa, construídas nos séculos 19 e 20, bem como um bispado copta em Cartum, Sudão. A igreja também tem uma pequena presença na América do Norte, Austrália e Reino Unido. As igrejas ortodoxa etíope, armênia e siríaca são todas igrejas ortodoxas orientais em comunhão com a Igreja Ortodoxa Copta. As igrejas ortodoxas orientais foram consideradas heréticas por séculos pelas igrejas católica romana e ortodoxa oriental. Desde o final do século 20, no entanto, a Igreja Ortodoxa Copta, como outras igrejas ortodoxas orientais, entrou em diálogo com ambos, resolvendo muitas disputas teológicas e conquistando reconhecimento como doutrinária na corrente principal do cristianismo ortodoxo.
