Como parte do Território de Confiança das Ilhas do Pacífico (TTPI), administrado pelos Estados Unidos, Palau estava sob as bandeiras das Nações Unidas, dos Estados Unidos e do Território de Confiança. O desejo local de um estado e governo separados foi realizado em 1º de janeiro de 1981, e uma bandeira de Palauan foi hasteada nessa ocasião. Uma competição foi realizada em 1979, que resultou em mais de mil propostas; o escolhido foi criado por Blau Skebong e foi aprovado pelo novo governo em 22 de outubro de 1980. Essa bandeira ainda está em uso hoje.
O disco de ouro representa a lua, que tem um significado especial para a cultura Palauan. A lua cheia é tradicionalmente considerada a melhor época para pesca, plantio e outras atividades. Diz-se que dá à população local "uma sensação de calor, tranquilidade, paz, amor e unidade doméstica". O fundo da bandeira não é, como seria de esperar, um símbolo do Oceano Pacífico; ao contrário, refere-se à "passagem final da autoridade administrativa estrangeira de nossa terra". A independência total não foi alcançada por Palau até outubro de 1994, mas nenhuma alteração foi feita na bandeira naquele momento. A bandeira original de 1981 é preservada no Museu Palau, na capital, Koror. A bandeira de Palauan é semelhante em design à bandeira de Bangladesh, mas as duas têm cores e simbolismos diferentes.
